Научно-исследовательская работа в семинарии осуществляется по таким направлениям, как библеистика, апологетика, миссиология, догматическое, сравнительное, нравственное и пастырское богословие, литургика, исламоведение, история Церкви и многие другие.
18 сентября в Казанской православной духовной семинарии в рамках республиканской акции «Экстремизму — нет!» состоялся спортивный праздник, в котором приняли участие студенты Российского исламского института и учащиеся семинарии.