Уважаемый Дмитрий.
Вопрос Ваш больной, т.к. случай Ваш уже не единственный. Видимо, необходимо объяснить историю вопроса. Люди, имеющие отношения в крещении (восприемник и чадо, например) считаются духовными родственниками. Поэтому им и нельзя вступать в супружество, это почти как кровосмешение, но в духовном плане. Поэтому, кстати, близким родственникам и нельзя быть восприемниками. Данная традиция сложилась давно, когда практически все население было воцерковленным. Сегодня же православных воцерковленных людей мало, поэтому истории, подобные вашей, стали встречаться чаще. Однако, в Вашем случае имеет место несколько другая ситуация. Вступающие в союз состоят в духовной и родственной связи с сыном. Но не с друг другом. Кроме того, крестный может быть отличным отцом, так как он не чужой человек мальчику, которому он будет отчимом. Поэтому если уж в ситуации более тесного духовного родства (описанной вами) было предложено обратиться к епископу, можно и Вам рекомендовать обсудить вопрос с духовником, и, возможно, обратиться к епископу для детального рассмотрения.